Система водоотведения г.Печора – общесплавная. В состав системы водоотведения входят: система трубопроводов, канализационные насосные станции перекачки, главная канализационная насосная станция, очистные сооружения канализации. В систему канализации принимаются совместно хозяйственно-бытовые и производственные сточные воды г. Печора, пос.Макаронная фабрика и пос.Луговой. Сточная вода от потребителя, по системе внутренних и наружных трубопроводов, подается в приемные резервуары канализационных станций перекачки и далее в приемный резервуар главной насосной станции, после чего по двум напорным трубопроводам – на очистные сооружения канализации. Перекачка сточных вод ведется 13 насосными станциями.
МУП «Горводоканал» производит контроль за количеством, составом и свойствами сточных вод, сбрасываемых абонентами в центральную систему канализации. Испытательной лабораторией сточной воды и воды поверхностных водоисточников МУП «Горводоканал» (свидетельство о состоянии измерений в лаборатории №5-2013/61 от 15.03.2013 г., действительно до 15.03.2016 г.) проводятся плановые отборы проб сточных вод промышленных абонентов. За сверхнормативный сброс сточных вод и загрязняющих веществ с предприятий взимается дополнительная оплата.
Канализационные сети испытывают нагрузки не только из-за повышенной концентрации загрязняющих веществ в принимаемых сточных водах, но и из-за увеличения объемов сточных вод при весеннем таянии снега. Система ливневой канализации отсутствует. Весь поверхностный сток (талые и дождевые воды) направляется в систему канализации и не оплачивается абонентами. Талые и дождевые сточные воды поступают на очистные сооружения канализации, хотя не нуждаются в такой сложной очистке, как бытовые сточные воды.
Протяженность канализационных сетей и коллекторов — 106,4 км.